انواع مختلف RNA:

1- mRNA که به عنوان پیک عمل کرده و در سنتز پروتئین به عنوان ناقل اطلاعات ژنی عمل می کند و از روی آن پروتئین ساخته می شود.

tRNA: که به عنوان ناقل آمینو اسید عمل کرده و در سنتز پروتیئن شرکت می کند به طوریکه آمینو اسید به انتهای 3' به A وصل شده و انتقال می یابد و در بازوی مقابل دارای آنتی کرون می باشد که مشخص کننده نوع tRNA و آمینواسید متصل به آن است. شکل ناقل این مولکول به صورت برگ شرری و شکل فعال در سلول بصورت L برعکس شده می باشد.

rRNA: یکی دیگر از انواع RNA می باشد که در ساختار ریبوزوم شرکت کرده و در سنتز پروتئین نقش آنزیمی دارد.

sn RNA: مولکولهای RNA کوچک هسته ای هستند و زیر مجموعه ای از مولکول RNA کوچک می باشد و به میزان قابل توجه ای در امر پردازش mRNA و تنظیم ژن شرکت دارند از میان چند sn RNA: - u₆-u₅-u₄-u₃-u₂-u₁ در حذف اینترون ها و پردازش hn RNA به mRNA مشارکت دارند.

si RNA: زیر مجموعه ای دیگر از RNA کوچک هستند که نقش مهمی در تنظیم بیان ژن دارند یکسری ازsi RNA بهمراه Emi RNA بیان ژن را از طریق مکانیسم های خاص کنترل می کنند.

miRNA: این مولکولها طول برابر 21-25 نوکلئوتید دارند و با پردازش نوکلئوتیدی محصولات واحدها رونویسی و یا ژن های خاص بوجود می آیند. پس سازه ها miRNA تک رشته ای هستند ولی ساختمان 2 وسیعی دارند اما مولکولهای siRNA از طریق شکست نوکلئوتیدی مولکول RNA دورشته ای  خاص و بزرگ به مولکولهای کوچک با طول نوکلئوتیدی 21-25 بوجود می آیند.

این مولکولهای کوتاه بصورت بالقوه با مولکولهای هدف مشخص در هر قسمت mRNA تشکیل هیبریدهای RNA- RNA می دهند و این باعث کاهش تولید پروتئین های خاص می گردد. اما در مواقع خاص کمپلکس MRNA – si RNA توسط ماشین نوکلئوتیدی تجزیه می گردد.

Small nuclear RNA: snRNA

Small nuclear ribonucleic acid یک گروهی از مولکولهای RNA کوچک هستند که در درون هسته ی سلولهای یوکاریوتی پیدا شده اند. این snRNA ها به وسیله ی RNA PolymeraseII و یا  PolymeraseIII رونویسی می شوند و این ها از نوع RNA های کوچک هستند که در فرآیندهای پیچیده ای مثل RNA Splicing (حذف اینترون ها از hnRNA)، تنظیم فاکتورهای رونویسی (7SK RNA) یا تنظیم RNA پلی مرآز II (B2RNA) و نگهداری تلومرها شرکت می کنند. snRNA ها بوسیله ی پروتئین های خاصی بهم پیوند می شوند و این مجموعه ها به صورت (SNRNP) Small nuclear ribonucleo proteins و یا گاهی اوقات به صورت Snurps منتشر می شوند. این مولکولها غنی از یوریدین هستند. .  که این snRNRs در نوعی  اسپلایسینگ کاربرد دارند . اینترون های نوع سه انواعی هستند که در رونوشت های اولیه mRNA هسته ای یافت می شوند . که اینها با نوعی مکانیسم خاص اسپلایس می گردند . هر چند برای انجام اسپلایسینگ در این حالت نیاز به عمل کمپلکس های RNA-پروتیین اختصاصی به نام snRNP که اغلبsnurps تلفظ می گردند است . پنچ نوع snRNPs در اسپلایسینگ شرکت می کنند که در هسته یوکاریوتی وجود دارند . U1 که مکمل توالی ابتدایی رونوشت اولیه است متصل می شود و با اضافه شدن U2/U3/U4/U5/U6 کمپلکسی بنام اسپلاسیوزوم تشکیل واسپلاسینگ اتفاق می افتد 

 یک گروه بزرگی از nRNA sها به نام Small nuclear (Sno RNAS) شناخته شده اند که این ها مولکولهای RNA کوچکی هستند که یک نقش ضروری را در RNA زیستی و راهنمای تغییرات شیمیایی از ریبوزوم (rRNAS) و دیگر ژن های RNA بازی می کنند.

Sno RNAS ها در هسته مستقر شده اند یا در مکان بزرگ سنتز (Cajal bodies) RNA مستقر شده اند.

گروهی معتقدند که این RNA ها همان پرایمرهای شروع همانند سازی DNA در سلول هستند و گروهی دیگر عمل دخالت در فرآیند اصلاح RNA را به آنها نسبت می دهند. و گروهی هم این قطعات را حاصل از اینترون ها می دانند.

 scRNA  هم قطعات کوچک RNA موجود در سیتوپلاسم سلول هستند که مانند snRNA ها عمل آن ها بطور دقیق هنوز مشخص نشده است ولی گروهی از دانشمندان معتقدند که به عنوان قسمتی از بعضی آنزیمها عمل میکند.

RNA:siRNA(small interfering RNA)های مداخله کننده ی کوچک، گاهی اوقات به عنوان Short interfering RNA یا Silencing RNA معرفی می شوند. اینها از کلاس Double strand مولکولهای RNA هستند که 20 تا 25 نوکلئوتید در طول خود دارند که یک نقش بیولوژیکی متنوع را در سلول بازی می کنند. siRNA مطلقاً در جزء RNA interferenceدرگیر هستند که این مداخله ی siRNA با بیان ژن خاصی اتفاق می افتد. علاوه بر این siRNA ها در جزء RNAi related به عنوان یک مکانیسم ضد ویروس یا در شکل پذیری کروماتین یک ژن فعالیت می کنند و بوسیله این siRNAها پیچیدگی این چرخه ها به طور واضح مشخص و معین می شود.

siRNA ها برای اولین بار توسط گروه David Boulcombe به عنوان قسمتی از PTGS(post transcriptional gene silencing) در گیاهان کشف شد.

(Micro RNA) miRNA: تنظیم کننده های پس از رونویسی هستند که به سکانس های مکملی در 3'utRs (سه منطقه ی ابتدایی که غیرقابل ترجمه اند) از mRNA وصل می شوند که سبب خاموشی ژن می شوند. mRNA ها مولکولهای RNA کوتاهی هستند با طول متوسط 22 نوکلئوتید.

ژنوم انسان ممکن است 1000 تا miRNA را کدبندی کند که ممکنه حدوداً 60 درصد از ژن های پستانداران، هدف miRNA باشند که در انواع سلول های انسانی فراوان هستند و miRNA ممکن است صدها  mRNA را سرکوب کند. miRNA در ارگانیسم های یوکاریوتی محافظت می شوند و گمان می شود که این ها برای تنظیم ژن حیاتی می باشند.

ژن های miRNA ها معمولاً بوسیله  RNA  Polymerase II رونویسی می شوند. پلی مراز اغلب به پروموتور قالب نزدیک توالی رمزگذاری DNA وصل می شود که لوپ سنجاق سر ایجاد می کند و نتیجه ی رونویسی ایجاد capped با تغییر نوکلئوتیدی خاص در انتهای 5' است و همچنین اضافه شدن پلی آدنیلات در انتهای splicing, 3' انجام می شود.

miRNA ها و بیماری ها: میکرو RNA ها در فعالیت نرمال سلول های یوکاریوتی فعالیت دارند بنابراین بی نظمی در miRNA ها با بیماری مرتبط است.

miRNA و سلول های عصبی: miRNA ها سیستم عصبی را تنظیم می کنند. miRNA های عصبی در مراحل مختلف ایجاد سیناپتیک در گیرند. مثلاً در Dendritogenesis، شکل سیناپس و در بلوغ سیناپس ها. برخی مطالعات نشان می دهند که بیان miRNA ها در chizophrenia متناوب است.